脱硫石膏的后期处理主要包括综合利用和合规填埋两种方式，其中综合利用是更环保、经济的选择，具体处理方式如下：
　　综合利用
　　建材行业
　　石膏板生产：脱硫石膏经过脱水、干燥、制粉等处理后，可用于生产纸面石膏板、纤维石膏板等，这些石膏板具有优异的防火性能，广泛应用于室内隔墙和吊顶。
　　石膏砌块与砂浆：脱硫石膏还可用于制备石膏砌块、石膏砂浆等建筑材料，满足不同建筑需求。
　　水泥缓凝剂：脱硫石膏不含有对水泥性能有负面影响的杂质，适宜作水泥缓凝剂。掺入3%~5%的脱硫石膏，能正常调节水泥凝结时间，满足国家标准要求。同时，脱硫石膏中含有的CaCO3和少量可溶性盐，对促进水泥强度有利。
　　化工行业
　　制备硫酸和氧化钙：通过高温煅烧脱硫石膏，可以回收硫元素并生成碳酸钙/氧化钙。具体过程包括利用碳粉或一氧化碳与脱硫石膏在850~1000℃及催化剂条件下反应生成SO2，再通过高温氧化将SO2转化为SO3，最后通入浓硫酸中吸收得到硫酸。同时，煅烧过程中还会生成氧化钙，可用于制碱、建材等领域。
　　制备硫酸钙晶须：脱硫石膏还可用于制备硫酸钙晶须等功能材料，这些材料在塑料、橡胶增强等领域有广泛应用。
　　农业领域
　　土壤改良：经检测确保微量金属不超标后，脱硫石膏可用于土壤改良。它能够调节土壤酸碱度、补充钙硫元素，有利于盐分随着降雨或者灌溉进入更深的土壤，从而改善土壤结构。但需严格控制用量和土壤类型，例如改良碱化土壤的Z佳用量范围为0.5%~1.0%。
　　生态修复
　　盐碱地改良：脱硫石膏可用于中和盐碱地土壤碱性，改善土壤结构，提高土壤肥力。
　　矿山充填：脱硫石膏还可用于采空区充填，减少地面沉降风险，保障矿山安全。
　　合规填埋
　　若综合利用成本高或需求不足，脱硫石膏可运往合规固体废物填埋场进行填埋。但需确保填埋过程符合环保要求，如设置适当的防渗透设施，防止对地下水造成污染。